辞职不提前通知公司扣工资是不合法的，但若因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。
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对辞职扣工资的，合法与否还要看劳动者辞职是否符合规定，单位是否因此遭受不必要的损失等，否则一般是违法的。
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若劳动者劳动合同中的违约情况，有可能会被扣工资，扣工资是否合法需要结合实际情况而定。